Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SFT2D1-206ENST00000494682 359 ntTSL 35.69□□□□□ -1.53e-9■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.424e-7■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-10■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 ATP5F1-201ENST00000369721 1040 ntTSL 29.67□□□□□ -0.863e-10■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 ATP5F1-204ENST00000468818 859 ntTSL 35.42□□□□□ -1.543e-10■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 TOP1MT-207ENST00000519139 1561 ntTSL 521.75■■□□□ 1.074e-15■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-15■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.584e-15■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PAIP2-207ENST00000511381 365 ntTSL 519.67■□□□□ 0.747e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.26■□□□□ 0.357e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 MAT2B-208ENST00000523606 3210 ntTSL 212.75□□□□□ -0.377e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 MAT2B-202ENST00000321757 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.687e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.277e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 MAT2B-207ENST00000521838 1526 ntTSL 54.8□□□□□ -1.647e-21■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 NDUFV1-221ENST00000532244 786 ntTSL 221.25■□□□□ 0.993e-8■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 518.71■□□□□ 0.594e-6■□□□□ 8.4
PABPC4Q13310 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 329.77■■■□□ 2.361e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.288e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FZR1-205ENST00000588084 671 ntTSL 228.98■■■□□ 2.238e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.088e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.998e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PKN1-207ENST00000586557 899 ntTSL 526.22■■□□□ 1.798e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 R3HCC1-208ENST00000522012 1500 ntTSL 1 (best)24.51■■□□□ 1.518e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 MYCBP-204ENST00000495043 819 ntTSL 224.46■■□□□ 1.518e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.438e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.428e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-205ENST00000563145 859 ntTSL 223.75■■□□□ 1.398e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 523.42■■□□□ 1.348e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.228e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-215ENST00000568263 1482 ntTSL 221.67■■□□□ 1.068e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ARHGEF2-208ENST00000470541 1877 ntTSL 321.46■■□□□ 1.038e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.978e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.968e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.968e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-210ENST00000565570 1844 ntTSL 520.88■□□□□ 0.938e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.898e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 220.31■□□□□ 0.841e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.788e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.718e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 319.44■□□□□ 0.71e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.548e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-206ENST00000563444 529 ntTSL 217.63■□□□□ 0.418e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.398e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.388e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-209ENST00000574450 517 ntTSL 217.1■□□□□ 0.338e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-210ENST00000575396 449 ntTSL 317.1■□□□□ 0.338e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.298e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.278e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PKN1-211ENST00000588200 548 ntTSL 316.32■□□□□ 0.28e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.158e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ERI3-207ENST00000479101 367 ntTSL 315.93■□□□□ 0.148e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.068e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 515.41■□□□□ 0.068e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.018e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AL139260.3-202ENST00000454994 2381 ntTSL 214.98□□□□□ -0.018e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.018e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-201ENST00000380962 1529 ntTSL 214.71□□□□□ -0.058e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.068e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 IFI30-203ENST00000600463 2116 ntTSL 214.59□□□□□ -0.078e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.168e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.178e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.198e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.38e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.38e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-204ENST00000564011 1168 ntTSL 513.07□□□□□ -0.328e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.338e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 512.62□□□□□ -0.391e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ILK-214ENST00000534706 790 ntTSL 512.49□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PIEZO1-211ENST00000495568 901 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-12■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-64■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ERI3-208ENST00000489710 394 ntTSL 311.64□□□□□ -0.558e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.558e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-207ENST00000572869 638 ntTSL 311.36□□□□□ -0.598e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-12■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.658e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.718e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-219ENST00000550733 754 ntTSL 210.56□□□□□ -0.728e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.728e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LCMT1-212ENST00000576625 640 ntTSL 510.51□□□□□ -0.738e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AL139260.3-201ENST00000489803 3231 ntTSL 210.45□□□□□ -0.748e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.858e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.878e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-12■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -11e-12■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.238e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.258e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 27.13□□□□□ -1.278e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AL139260.3-203ENST00000489575 477 ntTSL 26.99□□□□□ -1.298e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 56.63□□□□□ -1.358e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 ANAPC7-207ENST00000486321 748 ntTSL 26.19□□□□□ -1.428e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 MYCBP-202ENST00000465771 341 ntTSL 36.14□□□□□ -1.438e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-210ENST00000507306 561 ntTSL 34.69□□□□□ -1.668e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FRYL-220ENST00000641795 5566 nt4.65□□□□□ -1.678e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CALCOCO2-216ENST00000509784 578 ntTSL 44.47□□□□□ -1.698e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 LMNA-221ENST00000506981 576 ntTSL 223.05■■□□□ 1.287e-18■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.024e-9■□□□□ 8.3
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