Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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