Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms