Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFFO1Q0D2I5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms