Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDR1Q08345 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDR1Q08345 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms