Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms