Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PPARDQ03181 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms