Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDR2Q01850 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms