Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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