Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HBBP68871 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms