Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms