Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BACE1P56817 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BACE1P56817 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms