Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC12A2P55011 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms