Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HK3P52790 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HK3P52790 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms