Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms