Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms