Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD8P48556 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms