Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD4P46934 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms