Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXLNAP40222 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXLNAP40222 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms