Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA10P31260 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms