Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms