Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NELFEP18615 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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NELFEP18615 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NELFEP18615 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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