Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB1P11230 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms