Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN9O95484 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN9O95484 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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