Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALUO43852 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALUO43852 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALUO43852 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALUO43852 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALUO43852 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms