Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF208O43345 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF208O43345 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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