Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms