Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QRK9 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QRK9 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QRK9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms