Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms