Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms