Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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