Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDR42E2A6NKP2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms