Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3CA6NKF2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3CA6NKF2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms