Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms