Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms