Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLKQ9UBT6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms