Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms