Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms