Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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