Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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