Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms