Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZBED2Q9BTP6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZBED2Q9BTP6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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