Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERPUD2Q9BSE4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms