Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KCNS3Q9BQ31 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms