Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DCLK2-202ENST00000302176 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PRKAG2-201ENST00000287878 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SERPINA10-202ENST00000393096 2451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF682-202ENST00000397162 3164 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNHIT6-201ENST00000370574 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PSPN-202ENST00000597721 3911 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL034417.4-201ENST00000641354 2101 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GAA-201ENST00000302262 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ACTC1-201ENST00000290378 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 SLC12A3-202ENST00000438926 5567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 AC006372.3-201ENST00000444158 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PRAC1Q96KF2 GRIK1-205ENST00000399909 3427 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms