Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN4Q92575 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms