Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SRSF12Q8WXF0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms