Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF182Q8N6D2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms