Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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