Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ZNF493Q6ZR52 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms